Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3b2E9Q3E1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Aldh3b2E9Q3E1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh3b2E9Q3E1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh3b2E9Q3E1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh3b2E9Q3E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh3b2E9Q3E1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh3b2E9Q3E1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b2E9Q3E1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh3b2E9Q3E1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms