Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc6D3YZP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc6D3YZP9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc6D3YZP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc6D3YZP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc6D3YZP9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc6D3YZP9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc6D3YZP9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc6D3YZP9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc6D3YZP9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc6D3YZP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc6D3YZP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccdc6D3YZP9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc6D3YZP9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc6D3YZP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc6D3YZP9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc6D3YZP9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc6D3YZP9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc6D3YZP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc6D3YZP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc6D3YZP9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc6D3YZP9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc6D3YZP9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc6D3YZP9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc6D3YZP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ccdc6D3YZP9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc6D3YZP9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc6D3YZP9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc6D3YZP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc6D3YZP9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc6D3YZP9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc6D3YZP9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc6D3YZP9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc6D3YZP9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc6D3YZP9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc6D3YZP9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc6D3YZP9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc6D3YZP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc6D3YZP9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc6D3YZP9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc6D3YZP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc6D3YZP9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc6D3YZP9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc6D3YZP9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc6D3YZP9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc6D3YZP9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc6D3YZP9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc6D3YZP9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc6D3YZP9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc6D3YZP9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc6D3YZP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc6D3YZP9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc6D3YZP9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc6D3YZP9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc6D3YZP9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc6D3YZP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc6D3YZP9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc6D3YZP9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc6D3YZP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc6D3YZP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc6D3YZP9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc6D3YZP9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc6D3YZP9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc6D3YZP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc6D3YZP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc6D3YZP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc6D3YZP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc6D3YZP9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc6D3YZP9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc6D3YZP9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc6D3YZP9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc6D3YZP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc6D3YZP9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc6D3YZP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc6D3YZP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc6D3YZP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc6D3YZP9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc6D3YZP9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc6D3YZP9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms