Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm7257D3YX25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm7257D3YX25 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm7257D3YX25 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm7257D3YX25 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm7257D3YX25 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7257D3YX25 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7257D3YX25 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7257D3YX25 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7257D3YX25 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm7257D3YX25 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7257D3YX25 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm7257D3YX25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm7257D3YX25 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm7257D3YX25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7257D3YX25 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7257D3YX25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7257D3YX25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7257D3YX25 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm7257D3YX25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm7257D3YX25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms