Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC56.12■■■■■ 6.57
Abcc8B2RUS7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.08■■■■■ 6.57
Abcc8B2RUS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.05■■■■■ 6.56
Abcc8B2RUS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.04■■■■■ 6.56
Abcc8B2RUS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
Abcc8B2RUS7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC55.97■■■■■ 6.55
Abcc8B2RUS7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC55.95■■■■■ 6.55
Abcc8B2RUS7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
Abcc8B2RUS7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC55.79■■■■■ 6.52
Abcc8B2RUS7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC55.78■■■■■ 6.52
Abcc8B2RUS7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.77■■■■■ 6.52
Abcc8B2RUS7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC55.7■■■■■ 6.51
Abcc8B2RUS7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.66■■■■■ 6.5
Abcc8B2RUS7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC55.64■■■■■ 6.5
Abcc8B2RUS7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC55.64■■■■■ 6.5
Abcc8B2RUS7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
Abcc8B2RUS7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC55.61■■■■■ 6.49
Abcc8B2RUS7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC55.57■■■■■ 6.49
Abcc8B2RUS7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.56■■■■■ 6.48
Abcc8B2RUS7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC55.53■■■■■ 6.48
Abcc8B2RUS7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.53■■■■■ 6.48
Abcc8B2RUS7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.52■■■■■ 6.48
Abcc8B2RUS7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.51■■■■■ 6.48
Abcc8B2RUS7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC55.5■■■■■ 6.47
Abcc8B2RUS7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC55.48■■■■■ 6.47
Abcc8B2RUS7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.47■■■■■ 6.47
Abcc8B2RUS7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.44■■■■■ 6.47
Abcc8B2RUS7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.44■■■■■ 6.47
Abcc8B2RUS7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55.42■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC55.42■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.41■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.4■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.39■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC55.38■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC55.38■■■■■ 6.46
Abcc8B2RUS7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.32■■■■■ 6.45
Abcc8B2RUS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC55.31■■■■■ 6.44
Abcc8B2RUS7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.28■■■■■ 6.44
Abcc8B2RUS7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.26■■■■■ 6.44
Abcc8B2RUS7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
Abcc8B2RUS7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC55.24■■■■■ 6.43
Abcc8B2RUS7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.23■■■■■ 6.43
Abcc8B2RUS7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.22■■■■■ 6.43
Abcc8B2RUS7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
Abcc8B2RUS7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
Abcc8B2RUS7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC55.2■■■■■ 6.43
Abcc8B2RUS7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.42
Abcc8B2RUS7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
Abcc8B2RUS7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC55.15■■■■■ 6.42
Abcc8B2RUS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
Abcc8B2RUS7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC55.13■■■■■ 6.42
Abcc8B2RUS7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC55.08■■■■■ 6.41
Abcc8B2RUS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC55.06■■■■■ 6.41
Abcc8B2RUS7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC55.06■■■■■ 6.4
Abcc8B2RUS7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC55.01■■■■■ 6.4
Abcc8B2RUS7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
Abcc8B2RUS7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
Abcc8B2RUS7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC54.9■■■■■ 6.38
Abcc8B2RUS7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC54.9■■■■■ 6.38
Abcc8B2RUS7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC54.89■■■■■ 6.38
Abcc8B2RUS7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC54.86■■■■■ 6.37
Abcc8B2RUS7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC54.77■■■■■ 6.36
Abcc8B2RUS7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC54.77■■■■■ 6.36
Abcc8B2RUS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC54.76■■■■■ 6.36
Abcc8B2RUS7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC54.76■■■■■ 6.36
Abcc8B2RUS7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC54.7■■■■■ 6.35
Abcc8B2RUS7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC54.68■■■■■ 6.34
Abcc8B2RUS7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.65■■■■■ 6.34
Abcc8B2RUS7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.32
Abcc8B2RUS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC54.55■■■■■ 6.32
Abcc8B2RUS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC54.53■■■■■ 6.32
Abcc8B2RUS7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC54.52■■■■■ 6.32
Abcc8B2RUS7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC54.51■■■■■ 6.32
Abcc8B2RUS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.48■■■■■ 6.31
Abcc8B2RUS7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC54.46■■■■■ 6.31
Abcc8B2RUS7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
Abcc8B2RUS7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
Abcc8B2RUS7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.34■■■■■ 6.29
Abcc8B2RUS7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
Abcc8B2RUS7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.32■■■■■ 6.29
Abcc8B2RUS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC54.31■■■■■ 6.28
Abcc8B2RUS7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC54.29■■■■■ 6.28
Abcc8B2RUS7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.28■■■■■ 6.28
Abcc8B2RUS7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC54.27■■■■■ 6.28
Abcc8B2RUS7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC54.24■■■■■ 6.27
Abcc8B2RUS7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC54.23■■■■■ 6.27
Abcc8B2RUS7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC54.2■■■■■ 6.27
Abcc8B2RUS7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
Abcc8B2RUS7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.17■■■■■ 6.26
Abcc8B2RUS7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
Abcc8B2RUS7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC54.12■■■■■ 6.26
Abcc8B2RUS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
Abcc8B2RUS7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.11■■■■■ 6.25
Abcc8B2RUS7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
Abcc8B2RUS7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
Abcc8B2RUS7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
Abcc8B2RUS7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
Abcc8B2RUS7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
Abcc8B2RUS7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
Abcc8B2RUS7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms