Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Uhrf1bp1B2KF50 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Uhrf1bp1B2KF50 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Uhrf1bp1B2KF50 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Uhrf1bp1B2KF50 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Uhrf1bp1B2KF50 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Uhrf1bp1B2KF50 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Uhrf1bp1B2KF50 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Uhrf1bp1B2KF50 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Uhrf1bp1B2KF50 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Uhrf1bp1B2KF50 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Uhrf1bp1B2KF50 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Uhrf1bp1B2KF50 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Uhrf1bp1B2KF50 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1B2KF50 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1B2KF50 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Uhrf1bp1B2KF50 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Uhrf1bp1B2KF50 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1B2KF50 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1B2KF50 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Uhrf1bp1B2KF50 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Uhrf1bp1B2KF50 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms