Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pfkfb3A7UAK5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pfkfb3A7UAK5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pfkfb3A7UAK5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Pfkfb3A7UAK5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Pfkfb3A7UAK5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pfkfb3A7UAK5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pfkfb3A7UAK5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pfkfb3A7UAK5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pfkfb3A7UAK5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pfkfb3A7UAK5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pfkfb3A7UAK5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pfkfb3A7UAK5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pfkfb3A7UAK5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pfkfb3A7UAK5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pfkfb3A7UAK5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pfkfb3A7UAK5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pfkfb3A7UAK5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pfkfb3A7UAK5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pfkfb3A7UAK5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pfkfb3A7UAK5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pfkfb3A7UAK5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pfkfb3A7UAK5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pfkfb3A7UAK5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pfkfb3A7UAK5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pfkfb3A7UAK5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pfkfb3A7UAK5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pfkfb3A7UAK5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pfkfb3A7UAK5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.1 ms