Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5640A3KG49 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm5640A3KG49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5640A3KG49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm5640A3KG49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5640A3KG49 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm5640A3KG49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5640A3KG49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5640A3KG49 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5640A3KG49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5640A3KG49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5640A3KG49 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5640A3KG49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5640A3KG49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5640A3KG49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5640A3KG49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm5640A3KG49 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5640A3KG49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5640A3KG49 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5640A3KG49 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5640A3KG49 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5640A3KG49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5640A3KG49 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5640A3KG49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5640A3KG49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms