Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samt1A2BED8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samt1A2BED8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samt1A2BED8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samt1A2BED8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samt1A2BED8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt1A2BED8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt1A2BED8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt1A2BED8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt1A2BED8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms