Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AgrnA2ASQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AgrnA2ASQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AgrnA2ASQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AgrnA2ASQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AgrnA2ASQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AgrnA2ASQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AgrnA2ASQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AgrnA2ASQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AgrnA2ASQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AgrnA2ASQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AgrnA2ASQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AgrnA2ASQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AgrnA2ASQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AgrnA2ASQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AgrnA2ASQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AgrnA2ASQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AgrnA2ASQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AgrnA2ASQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AgrnA2ASQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AgrnA2ASQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AgrnA2ASQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AgrnA2ASQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AgrnA2ASQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AgrnA2ASQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AgrnA2ASQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AgrnA2ASQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AgrnA2ASQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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