Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv26A0A0B4J1P5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv26A0A0B4J1P5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv26A0A0B4J1P5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv26A0A0B4J1P5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms