Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M6

Gm27027, Predicted gene, 27027 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27027S4R1M6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27027S4R1M6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27027S4R1M6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms