Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knop1Q9Z2Q2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knop1Q9Z2Q2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms