Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Nup160Q9Z0W3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nup160Q9Z0W3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms