Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv2Q9WTR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpv2Q9WTR1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms