Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6cQ9WTM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6cQ9WTM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms