Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Six6Q9QZ28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Six6Q9QZ28 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms