Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx4Q9QY61 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms