Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm4Q9QXA5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms