Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dkk3Q9QUN9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dkk3Q9QUN9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms