Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgn5Q9JL35 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgn5Q9JL35 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgn5Q9JL35 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms