Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx20Q9JJY4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx20Q9JJY4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx20Q9JJY4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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