Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riox1Q9JJF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Riox1Q9JJF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riox1Q9JJF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms