Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LratQ9JI60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LratQ9JI60 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LratQ9JI60 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms