Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4bQ9ES61 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4bQ9ES61 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4bQ9ES61 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.7 ms