Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfcp2Q9ERA0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tfcp2Q9ERA0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfcp2Q9ERA0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms