Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SgshQ9EQ08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SgshQ9EQ08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms