Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r50Q9EP51 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r50Q9EP51 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms