Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlirpQ9D8T7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms