Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms