Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm5Q9D806 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms