Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc3Q9D6Y1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc3Q9D6Y1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms