Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc105Q9D4K7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc105Q9D4K7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms