Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp2bpQ9D4C6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms