Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930548H24RikQ9D496 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930548H24RikQ9D496 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930548H24RikQ9D496 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms