Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx20Q9D2Y5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx20Q9D2Y5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx20Q9D2Y5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms