Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chordc1Q9D1P4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chordc1Q9D1P4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chordc1Q9D1P4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms