Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd11Q9CZG9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd11Q9CZG9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms