Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm8Q9CXT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm8Q9CXT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms