Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp23Q9CX11 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp23Q9CX11 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms