Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Prkrip1Q9CWV6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms