Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc96Q9CR92 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc96Q9CR92 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms