Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CR55 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CR55 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CR55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CR55 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CR55 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR55 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR55 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR55 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CR55 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CR55 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CR55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CR55 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CR55 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CR55 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms