Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms