Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms