Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mid1ip1Q9CQ20 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms