Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN0

Slc5a5, Sodium/iodide cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a5Q99PN0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a5Q99PN0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a5Q99PN0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms