Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rrbp1Q99PL5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rrbp1Q99PL5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rrbp1Q99PL5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms