Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim3Q99PE5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms