Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gps1Q99LD4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gps1Q99LD4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms