Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TriobpQ99KW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
TriobpQ99KW3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms